2月1日，《中共中央国务院关于2009年促进农业稳定发展农民持续增收的若干意见》（下称《意见》）公布，中国人民大学农业与农村发展学院博士生导师、党委书记兼副院长孔祥智教授认为，今年一号文件的主题就是在文件的开篇所说的“四个词、十个字”，即“稳粮、增收、强基础、重民生”，重点在前两个词，即文件所说的两个“千方百计”：“千方百计保证国家粮食安全和主要农产品有效供给,千方百计促进农民收入持续增长,为经济社会又好又快发展继续提供有力保障”。
新世纪6个一号文件奠定了城乡统筹的基础。孔祥智表示，改革30年来，中央发布的11个一号文件对农村改革和发展起到巨大的推动作用。可以说，一号文件对农村改革起到了画龙点睛的作用。前五个一号文件对当时的农村改革起到了巨大的推动作用，尤其是1982年发表的第一个一号文件为“双包”制改革定了性，极大地调动了广大农民和干部的积极性，深为老农口的干部和广大农民所怀念。
后6个一号文件奠定了城乡统筹的基础。上个世纪90年代，农民负担屡减不轻，农村社会事业严重滞后，社会矛盾有激化的趋势；从1997年起，农民收入进入了低速增长的循环，城乡居民收入差距不断扩大。在这一严峻的形势下，胡锦涛总书记在2003年的中央经济工作会议上指出，要把解决三农问题作为全部工作的重中之重。2004年2月，中央发布了新世纪以来关于三农问题的第一个一号文件，指出要“按照统筹城乡经济社会发展的要求，坚持“多予、少取、放活”的方针，调整农业结构，扩大农民就业，加快科技进步，深化农村改革，增加农业投入，强化对农业支持保护，力争实现农民收入较快增长，尽快扭转城乡居民收入差距不断扩大的趋势。”2005年1月，新世纪第二个一号文件发布，指出“要把加强农业基础设施建设，加快农业科技进步，提高农业综合生产能力，作为一项重大而紧迫的战略任务，切实抓紧抓好。”2006年2月发布的新世纪第三个一号文件，提出了“统筹城乡经济社会发展，扎实推进社会主义新农村建设”的中长期历史任务。2007年的一号文件再次强调“坚持把解决好‘三农’问题作为全党工作的重中之重，统筹城乡经济社会发展，实行工业反哺农业、城市支持农村和多予少取放活的方针”，提出要“切实加大农业投入，积极推进现代农业建设，强化农村公共服务，深化农村综合改革”。2008年的一号文件再次把农民增收作为主题词，提出要“按照形成城乡经济社会发展一体化新格局的要求，突出加强农业基础建设，积极促进农业稳定发展、农民持续增收”。2009年的一号文件再次锁定农业稳定增长和农民持续增收，但基本措施仍然是加大国家财政对农业的投入力度。
“可见，新世纪以来的6个一号文件，尽管每年的主题不同，但都贯穿着城乡统筹这条主线，基本思想在于缩小城乡差距，提高农产品供给水平、农民收入水平和农村经济社会发展水平”，孔祥智说。